Criando em 1965 e localizado no interior do Jardim Botânico de Curitiba, é um dos quatro maiores museus botânicos do Brasil e tem seu acervo composto de plantas, frutos e madeiras secas, bem como líquens, fungos e algas. Há um local com exposições temáticas, uma sala de Educação Ambiental e um herbário no piso inferior do prédio (com acesso limitado). O acervo pode ser consultado pela população em geral, por estudantes e professores, bem como por pesquisadores do mundo inteiro.